于的是基因组序列,解决的办法是:
(1)对照其它物种同源基因的结构分析,选取跨相邻两个外显子区域设计引物,扩增基因组DNA ,将PCR产物直接测序确证后,用于进一步实验分析;
(2)对于RH定位,还可以参考文献(毕安定等,2000年 )中的方法,利用3’UTR区域设计引物进行扩增。
2.2.4 基因与数量性状的连锁分析方面也是国内外动物遗传育种领域的重点问题,有关报道很多。目前本室通过霍英东青年教师基金项目的研究,已在连锁分析方法方面已经积累了较丰富的经验,并取得了一定的研究成果。
此外,我们还会得到国际著名的遗传统计专家,美国北卡莱纳州立大学统计系***教授的指导和帮助。因此,新基因的连锁分析也是可行的。
2.2.5 其它有关问题。本申请项目拟研究4—6个新基因的全长cDNA(或近全长cDNA)的分离、测序、结构分析、遗传与物理定位及基因与数量性状的关联等,研究内容系统,但工作量适中,绝大部分研究内容是建立在在本室所承担的国家自然科学基金项目研究所建立的多项技术和研究成果基础上,是完全可行的。
因此可见,本申请项目研究内容可在国家自然科学基金资助的强度和资助的时间内完成。
3. 本项目的特色与创新之处
3.1 研究目的新。 本研究旨在分离、鉴定猪12号染色体上新功能基因的全长cDNA(或近全长cDNA)。
3.2 主要研究手段新。本申请项目将是首次利用电子信息杂交筛选策略分离猪12号染色体上新功能基因。
3.3 实验方法有改进和创新。
(1) 采用改良的阻抑性RACE克隆全长cDNA,该方法避免了工作量很大的cDNA文库构建及筛选步骤,并且可以在不了解基因两端序列情况下,只要一个高同源性引物即可克隆完整目的cDNA。
(2)采用辐射杂种细胞株定位系统(RH)进行新基因的染色体物理定位,RH技术是基于成熟的实验和统计分析方法,具有简单易行,定位精确度高并且利于进行不同实验室间定位结果的相互比较。
3.4 研究工作较系统。既研究新基因的分离、测序及结构分析,又研究其遗传与物理定位、遗传规律及与经济性状的关联。
3.5 本项目研究的顺利实施将有助于加强我国猪基因分离的速度与竞争力,这对于我国积极参与国际上猪基因产权的争夺有积极作用,因此,本项目有良好的应用前景。
4. 年度研究计划及预期进展
2002.1.—2002.12. 候选基因的筛选、克隆与序列测定。
2003.1.—2003.12. 新分离基因的结构分析、遗传与染色体物理定位。
2004.1.—20043.12. 新分离基因的遗传规律研究,基因与数量性状的连锁分析。完成总结报告。
5. 预期研究成果
5.1 分离猪12号染色体上4-6个功能基因的完整cDNA(或近全长cDNA)。 5.2 确定这4-6个新分离基因的结构特征、遗传规律及遗传与染色体物理定位。 5.3 分析这4-6个新分离基因与经济性状的关联。 5.4 提交1至多篇研究报告并将发表于中外核心期刊。
四、研究基础
1. 与项目有关的研究工作积累和已取得的研究工作成绩 1.1 已取得的研究工作成绩
1.1.1 围绕本申请项目已搜集了大量的文献资料,写出文献综述一篇发表(《中国家禽》2000(1));
1.1.2 本申请项目合作单位,美国 Case Western Reserve 大学医学院已惠赠特异的TnT 抗体用于检测TnT的特异性表达;
1.1.3在省自然科学基金资助下,已建立了从鸡血样中高质量的提取基因组DNA的技术,对鸡TnT基因的多态性研究也已经起步。 1.2 与项目有关的研究工作积累
1.2.1本研究室自组建以来已先后承担多项省、部级以上的科研课题,在这些课题的资助下,本研究室已熟悉掌握了PCR、PCR引物设计、电泳、基因组文库构建、分子克隆、基因定位、DNA顺序测定、多种DNA多态性检测、mRNA差异显示等分子生物学技术,以及多种统计分析方法,这为开展本申请项目奠定了良好的基础。
1.2.2通过本项目申请人及项目组和研究室成员参加的国家自然科学基金项目;霍英东青年教师基金;国家生物技术领域青年科学基金项目;省自然科学基金等项目的研究, 已建立了较为完善的?DNA、RNA提取、PCR扩增、多态分析及电泳检测、酶切、Southern杂交、Nouthern杂交、文库构建、基因定位、分子克隆、mRNA差异显示等技术,掌握了生物信息学的基本理论、方法和相关软件应用。?这些工作积累为本项目研究的顺利实施提供了技术保证。 1.2.3. 本课题组有一支结构合理,有不同专长(细胞生物学、分子生物学、统计分析与计算机技术以及性状测定、现场管理)的科研队伍。
1.2.4. 本课题组一直十分注重文献收集工作,每年均有人赴北京图书馆和中国农科院科技文献中心等单位检索文献,并随时通过国际互联网络查询检索最新的相关资料及从国内外专家、本室在国外的留学生得到文献,并讨论相关问题。因此,本课题组能及时了解国内外的发展现状、趋势及存在问题,这也是本申请课题能顺利完成的重要保证。
2.已具备的实验条件,尚缺少的实验条件或拟解决的途径(包括利用国家重点实验室和部门开放实验室的计划与落实情况)
2.1. 本项目的实验室研究部分将全部安排在本实验室完成。本实验室已拥有进行DNA、RNA分子生物学、细胞遗传学与育种研究所必需的分子生物学操作室, 细胞遗传学操作室, 无菌室, 暗室, 培养基室与同位素室, 拥有可进行PCR扩增、DNA多态性检测、分子克隆、分子杂交、基因定位、细胞遗传学分析所需的实验设备,拥有称量、恒温、干燥、细胞细菌培养、灭菌、离心、冷冻、搅拌、振荡、PCR扩增、电泳、分子杂交测序等基本设备, 其中包括三台超净工作台、三台台式高速离心机、曰立高速冷冻离心机、六台低温冰柜、冰箱、恒温冷冻摇床、两台进口PCR仪、ABI310序列分析仪、蛋白质/核酸浓度测定仪(DU640,美国),高压定时电泳仪、聚丙烯酰胺测序胶电泳槽、可见紫外检测仪、盖革计数器、Olympus荧光显微镜、液氮罐等, 还配有联网微机、刻录机、扫描仪及一些分子生物学和生物信息学分析所需的软件包, 如用于PCR引物设计的软件Primer designer,用于蛋白、DNA序列分析用的软件包DNASIS、Clustlw,检测已知序列DNA酶切位点的软件Restriction Mate, 用于基因克隆用的软件Clone及Enhancer,用于遗传定位的软件CRI-MAP等,以及其他有关数量遗传、群体遗传方面的软件。 2.2. 本室是农业部重点开放实验室
3. 申请者和项目组主要成员的学历和研究工作简历,近期发表的与本项目有关的主要论著目录和获得学术奖励情况及在本项目中承担的任务;青年科学基金申请者还应注明学位论文名称
及导师姓名与工作单位
3 .1. 申请者和项目组成员业务简介 5人
3.2 申请者和主要成员近期发表的与本项目有关的主要论著目录 50篇
? 页码?卷(期) ?年份?刊名?题目?论文:作者 年份?出版者?书名?专著:作者 五、经费预算 支 出 科 目 金 额
(万元) 计 算 根 据 及 理 由 1. 合计 18.00
1. 科研业务费 3.00 学术会议旅差费及会务费、文献检索费、复印费、 论文印刷或版面费等。
2. 实验材料费 13.00 试鸡管理、性状测定以及采样费、DNA及蛋白质 提取、引物合成、长PCR试剂盒、测序、各种限 制性酶,电泳(琼脂糖及聚丙烯酰胺)、蛋白质 印迹及表达量测定所需各种试剂费等。
3. 仪器设备 1.00 增设电泳仪及配套的电泳槽一套,液氮罐一个。
4. 项目组织实施费 1.00
注:预算支出科目按下列顺序填写;1. 科研业务费 2.实验材料费 3. 仪器设备费 4. 实验室改装费 5. 协作费 6.项目组织实施费。开支范围详见《国家自然科学基金资助项目财务管理办法》第二章。
六、申请者正在承担的其它研究项目
(攀登计划、863计划、攻关任务和各部委、省市任务等项目的名称及编号、任务来源、起止年月、负责或参加以及与本申请项目的关系等情部)
七、申请者承担(负责或参加)国家自然科学基金资助项目的情况 批准号 项目名称 起止年月 负责或参加 进展或完成情况
对申请者负责的前一个已结题科学基金资助项目(项目名称及批准号)完成情况、后续研究进展及与本申请项目的关系加以详细说明。另附该已结题项目《研究工作总结摘要》(300字)及已发表主要相关论文首页复印件(限三篇)。
八、申请者承诺
我保证上述填报内容的真实性。如果获得资助,我与本项目组成员将严格遵守国家自然科学基金委员会的有关规定,切实保证研究工作时间,按计划认真开展研究工作,按时报送有关材料。
申请者(签章) 2000年3月20曰
九、推荐意见
(不具有高级专业技术职务的申请者,须有两名具有高级专业技术职务的同行专家推荐。推荐时,请认真负责地介绍申请者及其项目组成员的业务基础、研究能力、科研态度及研究条件等。项目组成员不能做期者)
推荐者(签章) 专业技术职务 专长 所在单位:
推荐者(签章) 专业技术职务 专长 所在单位:
十、申请者所在单位及合作单位的审查与保证
1. 申请者所在单位学术委员会的审查意见(包括:对项目的意义、特色和创新之处及申请者的研究水平与学风签署具体意见)
本项目以鸡为材料,以特异性地在鸟类11个物种(包括家鸡)个体胸肌中表达的肌钙蛋白T基因为研究对象,引入较新的PCR-RF-SSCP分析技术,检测肌钙蛋白T基因的多态性,采用蛋白质印迹技术分析肌钙蛋白T基因在不同基因型中的蛋白质表达差异,并分析该基因的多态性、表达差异与鸡屠体性状的关系,从DNA水平和基因表达水平寻找影响鸡屠体性状的候选基因和遗传标记,对进一步研究基因的表达调控机制及改良鸡屠体性状具有重要意义。项目研究内容丰富新颖,目标明确,具有特色,技术路线设计合理,方案可行,所采用的大部分技术为申请者所在实验室的成熟技术,并且有国际合作的有利条件,完成课题有技术保障。
申请者近年来一直从事细胞遗传学和分子生物学的科研和教学工作,基础理论扎实,实验技术熟练,工作踏实,学风正派,主持一项湖北省自然科学基金项目,有较强的科研能力和组织协调能力。项目组成员结构合理,各有专长又相互补充,且以青年人为主,整体实力较强,并有多年合作经历,有能力按期完成申请项目。
同意申报
主任或副主任(签章) 2000年3月20曰
2. 合作单位的审查意见与保证
同意参加合作研究,保证对参加合作研究人员时间及工作条件的支持,督促其按计划完成所承担的任务(及需要说明的其它问题) 合作单位1 (公章)
合作单位2 (公章) 合作单位3 (公章)
3. 申请者所在单位领导的审查意见与保证
已按填报说明对申请人进行了资格审查,对申请书内容进行了审核,同意学术委员会的审查意见,并保证了项目获得资助后做到以下几点:
(1) 保证对研究计划实施所需的人力、物力和工作时间等条件给予支持。 (2) 严格遵守科学基金委员会有关资助项目管理、财务等各项规定。
(3) 督促项目负责人和本单位项目管理部门按科学基金委员会的规定及时报送有关报表和材料。
需要说明的其它问题:
单位负责人 (签章) 单位 (公章) 2000年3月20曰
我看了一下,论坛上大部分是医学或者生物学科的自然科学基金申请范本,现在我上传一份信息学科的自然科学基金申请书,2006年的申请期限就要到了,希望对大家有所帮助。 本人是新虫,不能上传附件,所有只能把内容拷贝到下面。
1.本项目研究的必要性及应用前景(国内外研究概况、水平、存在问题和发展趋势,学术
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