(2)、PCR 扩增突变基因,合成针对突变点的探针,将它与扩增产物杂交,杂交阳性说明有相应的基因突变存在。
11、什么是RT—PCR?什么是原位PCR?
答:(一)RT—PCR(逆转录PCR)
RT—PCR(reverse transcription PCR)是将 RNA 逆转录反应与 PCR反应联合应用的一种技术。首先,以RNA为模板,经逆转录得到cDNA,再以cDNA为模板,经 PCR 扩增目的基因。目前,RT—PCR是真核细胞mRNA进行定性及半定量分析的有效方法。
(二)原位PCR
原位PCR(in situ PCR)是在组织切片或细胞涂片的细胞内进行PCR。对扩增产物用特异性探针与之进行原位核酸杂交,从而检测出待测DNA或RNA的存在以及存在的部位。虽然这种方法的灵敏度不高,但它是目的基因定位的一个最佳方法。
12、非探针类实时荧光定量PCR的基本原理是什么?
答:原理:在常规PCR时,加入特殊的荧光染料SYBR Green,这种染料能与双链DNA的小沟区域结合。当这种染料未与DNA结合处于游离状态时,荧光信号强度极低。一旦它与双链DNA通过小沟区域结合后,荧光信号大大增强,约为游离时的1000倍。PCR扩增产物双链DNA越多,荧光信号就越强,下一轮循环变性时,双链DNA能形成单链,荧光近消失,待这一轮循环结束,产生双链DNA时,又出现大量荧光。这样,实时记录了荧光量即DNA量。
13、探针类实时荧光定量PCR有哪三种?试述TaqMan探针法的基本原理。
答:根据使用探针不同又分为:TagMan探针法,分子信标探针法及荧光共振能量转移探针法。
TaqMan探针法基本原理:
①在常规PCR反应体系中,加入一条能与模板DNA特异结合的TagMan探针,这个探针的5`端标记有荧光报告基团R(reporter, R),3`端标记有荧光淬灭基团Q(quencher,Q)。
②当探针上报告基团R及淬灭基团Q同时存在时,无荧光信号释放。当R基团与Q基团分离时,R基团便能产生荧光信号。
③PCR扩增时,DNA链合必延长,当遇到与模板DNA结合的探针时,Taq DNApol发挥5’ 3’核酸外切酶活性,将探针5‘ 端的R基团水解下来,产生荧光。由荧光检测系统收集。探针余下部分,继续由Taq DNApol 水解切除。PCR扩增继续向前,直至此循环结束。在下一轮循环,产生上述同样过程,收集荧光信号。 ④这样,TagMan 探针就在每一轮PCR扩增时,就实时测定PCR产物的量(荧光量)。
14、什么是基因组DNA文库?什么是cDNA文库?
答:从细胞中提取总基因组DNA,用相应的限制性核酸内切酶酶切,得到大小不同的许多各种基因片段,将这些基因片段分别与相应的基因载体(如噬菌体载体)连接重组。于是形成各种重组体,将所有这些重组体转导入合适的受体细胞中(如大肠杆菌),对受体细胞进行培养扩增,从而获得含有某种生物体全部基因片段的重组DNA克隆群体,它可以涵盖该种生物基因组的全部基因信箱,称之为基因组DNA文库。
从细胞(液)中提取mDNA,通过转录得到相应的各种cDNA 。然后将这些cDNA分别与相应的载体(质粒载体或噬菌体载体)连接,得到各种重组cDNA。将所
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